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華盛頓大學教授要3D掃描地球上所有現(xiàn)存魚類

童程童美 2017-01-18

在美國華盛頓大學,有一位教授正在致力于一項宏大的工程,他希望能夠親手3D掃描和數(shù)字化這個星球上近25000種現(xiàn)存的魚類。這意味著在網(wǎng)絡(luò)上將很快出現(xiàn)每種魚的高分辨率3D數(shù)字模型供所有人免費下載。

摘要

在美國華盛頓大學,有一位教授正在致力于一項宏大的工程,他希望能夠親手3D掃描和數(shù)字化這個星球上近25000種現(xiàn)存的魚類。這意味著在網(wǎng)絡(luò)上將很快出現(xiàn)每種魚的高分辨率3D數(shù)字模型供所有人免費下載。

華盛頓大學教授要3D掃描地球上所有現(xiàn)存魚類

這個人就是該校的生物學與水產(chǎn)漁業(yè)教授Adam Summers。他目前正在華盛頓大學的星期五港實驗室(Friday Harbor Laboratories)使用小型計算機斷層掃描(CT)儀對從世界各地收集來的魚類標本進行掃描。這臺設(shè)備有點像醫(yī)院里使用的標準CT設(shè)備:從不同的角度拍攝一系列X射線圖像,然后借助計算機生成其骨架的3D模型。

這個項目的是希望能夠幫助科學家們研究某一特定物種的形態(tài),或者試著理解為什么一群魚兒都有相似的物理特征,比如其骨質(zhì)的“頭盔”或者能夠埋入沙子的能力等。

“而且當把這些數(shù)據(jù)放到網(wǎng)絡(luò)上后,看到有人在使用它也很讓我開心?!盨ummers說。

因為直到現(xiàn)在,科學家們要獲得一個動物的詳細3D掃描仍然不是一件簡單——或者低成本——的事情。Summers就曾經(jīng)不得不祈求醫(yī)院幫他掃描幾種標本,其中包括一只,這只魟的CT掃描圖像在2000年首次出現(xiàn)在一份生物學雜志的封面上。

這么多年來,Summers和同事們已經(jīng)開發(fā)出了更加有效的方式可以在醫(yī)院 大批量地掃描標本,但每次掃描的成本仍然非常昂貴——從500美元至2000美元不等。

最終,Summers一咬牙籌集了34萬美元于去年11月份購買了一臺這樣的掃描設(shè)備,并將其放在了星期五港實驗室里開放給所有人使用。他的政策是任何人都可以免費使用它,但是魚必須是來自博物館的收藏品。

華盛頓大學教授要3D掃描地球上所有現(xiàn)存魚類

于是,世界各地的學生、博士后研究人員和教授都來到了位于圣胡安島(San Juan Island)的Summers的實驗室,來掃描他們最喜歡的標本。有的時候他們還會寄來帶魚類標本的盒子委托Summer的實驗室進行掃描并發(fā)布在網(wǎng)上。這些來自博物館的魚類標本可以通過其編碼進行追蹤。迄今為止,Summer的在線數(shù)據(jù)庫里已經(jīng)收錄了來自華盛頓大學Burke自然歷史與文化博物館、美國國家科學院、俄亥俄州立大學、西澳大利亞博物館等許多機構(gòu)收藏的魚類表面的3D掃描數(shù)據(jù)。

大多數(shù)科學家在使用魚類的3D數(shù)據(jù)時往往對于其形態(tài)測量數(shù)據(jù)更加感興趣三維魚——比如某根特定骨頭的長度——或者尋找以前從未見過的一個解剖面等。而數(shù)字化掃描結(jié)果可以使您從不同的角度觀察,或者進行放大,甚至將其3D打印出來。

據(jù)了解,Summers如今在通過一次掃描多個魚標本來加快他數(shù)字化全球魚類的過程。他會像墨西哥卷餅?zāi)菢訉讉€標本包在一起裝到一個圓筒里然后直接放在掃描儀里面。機器掃描完畢之后,Summers再通過軟件將這些魚分離開來生成不同的3D文件。

此外,他也不會以最高的分辨率進行掃描,因為實際上很少有科學家需要如此詳細的數(shù)據(jù),而且這也可以節(jié)省更多的時間和數(shù)字空間,并使人們更容易通過網(wǎng)絡(luò)獲得這些文件。

華盛頓大學教授要3D掃描地球上所有現(xiàn)存魚類

到目前為止,Summers的團隊已經(jīng)掃描了大約515個物種,其中大部分都已經(jīng)通過開源分享學術(shù)項目的網(wǎng)站Open Science Framework發(fā)布了出去。Summers預(yù)計要完成世界上所有魚類的掃描大約需要兩年半到三年的時間。

而Summers的下一步計劃是完成對地球上所有5萬種脊椎動物的3D掃描——他認為使用6臺像他現(xiàn)在使用的那種CT掃描儀就可以在幾年內(nèi)完成這一壯舉。

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